O usuário deve entregar o produto amplificado com iniciadores espeíficos para a região de interesse acoplados à sequência do adaptador Illumina como descrito abaixo:

Forward overhang: 5’ TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAG?[locusspecific sequence]

Reverse overhang: 5’ GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG?[locusspecific sequence]

O processo de preparação de bibliotecas utilizando o kit TruSeq Stranded mRNA envolve a quantificação das amostras de RNA (Qubit), qualificação das amostras de RNA (Bioanalyzer 1000), preparação das bibliotecas, quantificação das bibliotecas (Qubit), qualificação das bibliotecas (Bioanalyzer 1000) e a junção das bibliotecas para o sequenciamento. O sequenciamento é um serviço a parte e não está incluído neste processo.

O material biológico deve obedecer as seguintes condições:

- A massa de RNA Total necessária para a preparação das bibliotecas é de 3ug;

- No caso de iniciar a preparação das bibliotecas utilizando mRNA, o mesmo deverá ser obtido a partir de 1 a 4 ug de RNA Total.

- O RNA deve estar íntegro apresentando um valor de integridade > 8 (RIN Bioanalyzer);

- O fracionamento do RNA no Bioanalyzer faz parte do processo de avaliação de qualidade incluído no serviço.

O processo de preparação de bibliotecas utilizando o kit TruSeq Stranded Total RNA envolve a quantificação das amostras de RNA (Qubit), qualificação das amostras de RNA (Bioanalyzer 1000), depleção do rRNA, preparação das bibliotecas, quantificação das bibliotecas (Qubit), qualificação das bibliotecas (Bioanalyzer 1000) e a junção das bibliotecas para o sequenciamento. O sequenciamento é um serviço a parte e não está incluído neste processo.

O material biológico deve obedecer as seguintes condições:

- A massa de RNA Total necessária para a preparação das bibliotecas é de 3ug;

- O RNA deve estar íntegro apresentando um valor de integridade > 8 (RIN Bioanalyzer);

- O fracionamento do RNA no Bioanalyzer faz parte do processo de avaliação de qualidade incluído no serviço.

O processo de preparação de bibliotecas utilizando o kit TruSeq RNA envolve a quantificação das amostras de RNA (Qubit), qualificação das amostras de RNA (Bioanalyzer 1000), preparação das bibliotecas, quantificação das bibliotecas (Qubit), qualificação das bibliotecas (Bioanalyzer 1000) e a junção das bibliotecas para o sequenciamento. O sequenciamento é um serviço a parte e não está incluído neste processo.

Este kit permite a que o rRNA seja depletado utilizando um kit de depleção de RNA ribossomal ou enriquecimento para polyA.

O material biológico deve obedecer as seguintes condições:

- A massa de RNA Total necessária para a preparação das bibliotecas é de 3 ug;

- No caso de iniciar a preparação das bibliotecas utilizando mRNA, o mesmo deverá ser obtido a partir de 1 a 4 ug de RNA Total.

- O RNA deve estar íntegro apresentando um valor de integridade > 8 (RIN Bioanalyzer);

- O fracionamento do RNA no Bioanalyzer faz parte do processo de avaliação de qualidade incluído no serviço.

Corrida MiSeq contendo de 1 a 96 amostras.

Paired-end 2 x 250 bp.

Corrida MiSeq contendo de 1 a 96 amostras.

Paired-end 2 x 300 bp.

O RNA total ou mRNA deverá estar na concentração aproximada de 10ng/ul.

Cada chip tem a capacidade máxima de 11 amostras.

Caso o número de amostras seja menor que a capacidade do kit e o usuário não puder esperar outras amostras para completar o chip, será cobrado o valor integral do chip (11 amostras).

O equipamento tem capacidade de leitura de 1 amostra por vez.

Serão necessários 3,0 ul de amostra para a quantificação.

A leitura dos padrões será realizada por blocos de amostras a serem quantificadas.

A biblioteca de DNA ou RNA deverá estar na concentração aproximada de 30ng/ul.

Cada chip tem a capacidade máxima de 12 amostras.

Caso o número de amostras seja menor que a capacidade do kit e o usuário não puder esperar outras amostras para completar o chip, será cobrado o valor integral do chip (12 amostras).

A biblioteca de DNA ou RNA deverá estar na concentração aproximada de 5ng/ul.

Cada chip tem a capacidade máxima de 11 amostras.

Caso o número de amostras seja menor que a capacidade do kit e o usuário não puder esperar outras amostras para completar o chip, será cobrado o valor integral do chip (11 amostras).

O processo de preparação de bibliotecas utilizando o kit Nextera DNA Flex envolve a quantificação das amostras (Qubit), construção das bibliotecas, quantificação das bibliotecas (Qubit), qualificação das bibliotecas (Bioanalyzer 1000) e agrupamento das bibliotecas para o sequenciamento. O sequenciamento é um serviço a parte e não está incluído neste processo.

O material biológico deve obedecer as seguintes condições:

- A massa de gDNA íntegro necessária para genomas pequenos é de 500ng;

- A massa de gDNA íntegro necessária para genomas grandes e complexos é de 1ug;

- A integridade do gDNA deve ser registrada através de gel de agarose e encaminhada para avaliação.