Descrição

O serviço de Sequenciamento de DNA da Plataforma de Sequenciamento por Eletroforese Capilar- Metodologia Sanger, proporciona aos pesquisadores internos e externos à Fiocruz acesso à tecnologia de sequenciamento automático de DNA de alta qualidade.

A plataforma RPT01A oferece sequenciamento de DNA a partir de produtos de PCR e plasmídeos utilizando o ABI 3730 DNA Analyser, um sistema de análise de DNA de 96 capilares com a tecnologia Life Technologies – Applied Biosystems®. As reações de sequenciamento são feitas utilizando o BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit. As corridas são feitas em capilares de 50cm utilizando o polímero POP7. As sequências são analisadas pelo software Sequencing Analysis 5.4 utilizando o Base Caller KB. Nossas reações de sequenciamento alcançam em média 900 nucleotídeos (nt) com Q>20, e até 1100 nt com Q>10, com corridas de cerca de 2h/placa.

O equipamento pode ser alimentado com até 16 placas, para operação durante a noite, de segunda-feira a sexta-feira, e, excepcionalmente, durante o fim de semana. A plataforma aceita amostras individuais (em tubos, para placas compartilhadas com outros usuários) ou em placas.