RJ - Instituto Oswaldo Cruz
Endereço
Avenida Brasil 4365, - Manguinhos, Rio de Janeiro CEP: 21040900
Sequenciamento de Nova Geração - NextSeq 2000
A Plataforma de nova geração Illumina NextSeq2000 oferece preparação e/ou análise de bibliotecas de sequenciamento para aplicações de RNAseq, sequenciamento genômico, metagenômica e amplicons nos formatos single-end e pair-end. O NextSeq2000 apresenta throughput que varia de 100 milhões a 2,4 bilhões de reads.
Serviços oferecidos
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P01-015J : Construção de bibliotecas Nextera XT DNA
O processo de preparação de bibliotecas utilizando o kit Nextera XT envolve a quantificação das amostras (Qubit), construção das bibliotecas, quantificação das bibliotecas (Qubit), qualificação das bibliotecas (TapeStation) e agrupamento das bibliotecas para o sequenciamento. O sequenciamento é um serviço a parte e não está incluído neste processo.
O material biológico deve obedecer as seguintes condições:
- A massa de gDNA íntegro necessária para genomas pequenos é de 1ng.
Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.Sob consulta
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P01-015K : Construção de bibliotecas de Nextera DNA Flex
O processo de preparação de bibliotecas utilizando o kit Nextera DNA Flex envolve a quantificação das amostras (Qubit), construção das bibliotecas, quantificação das bibliotecas (Qubit), qualificação das bibliotecas (TapeStation 1000) e agrupamento das bibliotecas para o sequenciamento. O sequenciamento é um serviço a parte e não está incluído neste processo.
O material biológico deve obedecer as seguintes condições:
- A massa de gDNA íntegro necessária para genomas pequenos é de 500ng;
- A massa de gDNA íntegro necessária para genomas grandes e complexos é de 1ug;
- A integridade do gDNA deve ser registrada através de gel de agarose e encaminhada para avaliação.
Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.Sob consulta
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P01-015L : Construção de bibliotecas Amplicon
O usuário deve entregar o produto amplificado com iniciadores específicos para a região de interesse acoplados à sequência do adaptador Illumina como descrito abaixo:
Forward overhang: 5’ TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAG?[locusspecific sequence]
Reverse overhang: 5’ GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG?[locusspecific sequence]
Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.Sob consulta
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P01-015M : Construção de bibliotecas de TruSeq Stranded mRNA
O processo de preparação de bibliotecas utilizando o kit TruSeq Stranded mRNA envolve a quantificação das amostras de RNA (Qubit), qualificação das amostras de RNA (Tape Station), preparação das bibliotecas, quantificação das bibliotecas (Qubit), qualificação das bibliotecas (Tape Station 1000) e a junção das bibliotecas para o sequenciamento. O sequenciamento é um serviço a parte e não está incluído neste processo.
O material biológico deve obedecer as seguintes condições:
- A massa de RNA Total necessária para a preparação das bibliotecas é de 3ug;
- No caso de iniciar a preparação das bibliotecas utilizando mRNA, o mesmo deverá ser obtido a partir de 1 a 4 ug de RNA Total.
- O RNA deve estar íntegro apresentando um valor de integridade > 8 (RIN TapeStation);
- O fracionamento do RNA no Tape Station faz parte do processo de avaliação de qualidade incluído no serviço
Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.Indisponível no momento -
P01-015N : Construção de bibliotecas de TruSeq Stranded Total RNA
O processo de preparação de bibliotecas utilizando o kit TruSeq Stranded Total RNA envolve a quantificação das amostras de RNA (Qubit), qualificação das amostras de RNA (TapeStation 1000), depleção do rRNA, preparação das bibliotecas, quantificação das bibliotecas (Qubit), qualificação das bibliotecas (TapeStation 1000) e a junção das bibliotecas para o sequenciamento. O sequenciamento é um serviço a parte e não está incluído neste processo.
O material biológico deve obedecer as seguintes condições:
- A massa de RNA Total necessária para a preparação das bibliotecas é de 3ug;
- O RNA deve estar íntegro apresentando um valor de integridade > 8 (TapeStation);
- O fracionamento do RNA no TapeStation faz parte do processo de avaliação de qualidade incluído no serviço.
Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.Indisponível no momento -
P01-015A : Sequenciamento NextSeq 2000 P1 300 ciclosVocê precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.
Sob consulta
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P01-015B : Sequenciamento NextSeq 2000 P2 100 ciclosVocê precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.
Sob consulta
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P01-015C : Sequenciamento NextSeq 2000 P2 200 ciclosVocê precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.
Sob consulta
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P01-015D : Sequenciamento NextSeq 2000 P2 300 ciclosVocê precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.
Sob consulta
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P01-015E : Sequenciamento NextSeq 2000 P3 50 ciclosVocê precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.
Sob consulta
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P01-015F : Sequenciamento NextSeq 2000 P3 200 ciclosVocê precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.
Sob consulta
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P01-015G : Sequenciamento NextSeq 2000 P3 300 ciclosVocê precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.
Sob consulta
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P01-015H : Construção de bibliotecas ILLUMINA Strnd mRNAVocê precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.
Sob consulta
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P01-015I : Construção de bibliotecas ILLUMINA Strnd Total RNAVocê precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.
Sob consulta