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MG - Instituto René Rachou

Endereço

Augusto de Lima, 1715 - Barro Preto, Belo Horizonte CEP: 30190009

Sequenciamento de DNA de Nova Geração - NextSeq 500
A plataforma de sequenciamento de nova geração NextSeq Illumina oferece preparação e/ou análise de bibliotecas preparadas com kits para bibliotecas de RNA (TruSeq Stranded mRNA, TruSeq Stranded Total RNA, TruSeq Total RNA), de gDNA (Nextera DNA Flex) e de Metagenomas (Iniciadores específicos adicionados da sequência do adaptador e Nextera XT indices ou indices customizados). O NextSeq apresenta throughput que varia de 16 a 120 Gb e número de reads variando de 130 a 800 milhões. A plataforma oferece serviços de preparação de bibliotecas de sequenciamento e leitura das mesmas, a partir de 500 ng de DNA genômico de boa qualidade (260/280 > 1.8 e 260/230 entre 2.0 e 2.2) ou de no mínimo 2 µg de RNA Total de boa qualidade (RIN acima de 7).
Serviços oferecidos
  • P01-008L : Consultoria Clique para a descrição do serviço oferecido
    Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.

    Sob consulta

  • P01-008A : Construção de bibliotecas de Nextera DNA Flex Requer capacitação prévia Clique para a descrição do serviço oferecido

    O processo de preparação de bibliotecas utilizando o kit Nextera DNA Flex envolve a quantificação das amostras (Qubit), construção das bibliotecas, quantificação das bibliotecas (Qubit), qualificação das bibliotecas (Bioanalyzer 1000) e agrupamento das bibliotecas para o sequenciamento. O sequenciamento é um serviço a parte e não está incluído neste processo.

    O material biológico deve obedecer as seguintes condições:

    - A massa de gDNA íntegro necessária para genomas pequenos é de 500ng;

    - A massa de gDNA íntegro necessária para genomas grandes e complexos é de 1ug;

    - A integridade do gDNA deve ser registrada através de gel de agarose e encaminhada para avaliação.
    Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.

    Sob consulta

  • P01-008B : Construção de bibliotecas de TruSeq Stranded mRNA Requer capacitação prévia Clique para a descrição do serviço oferecido

    O processo de preparação de bibliotecas utilizando o kit TruSeq Stranded mRNA envolve a quantificação das amostras de RNA (Qubit), qualificação das amostras de RNA (Bioanalyzer 1000), preparação das bibliotecas, quantificação das bibliotecas (Qubit), qualificação das bibliotecas (Bioanalyzer 1000) e a junção das bibliotecas para o sequenciamento. O sequenciamento é um serviço a parte e não está incluído neste processo.

    O material biológico deve obedecer as seguintes condições:

    - A massa de RNA Total necessária para a preparação das bibliotecas é de 3ug;

    - No caso de iniciar a preparação das bibliotecas utilizando mRNA, o mesmo deverá ser obtido a partir de 1 a 4 ug de RNA Total.

    - O RNA deve estar íntegro apresentando um valor de integridade > 8 (RIN Bioanalyzer);

    - O fracionamento do RNA no Bioanalyzer faz parte do processo de avaliação de qualidade incluído no serviço.
    Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.

    Sob consulta

  • P01-008C : Construção de bibliotecas de TruSeq Stranded Total RNA Requer capacitação prévia Clique para a descrição do serviço oferecido

    O processo de preparação de bibliotecas utilizando o kit TruSeq Stranded Total RNA envolve a quantificação das amostras de RNA (Qubit), qualificação das amostras de RNA (Bioanalyzer 1000), depleção do rRNA, preparação das bibliotecas, quantificação das bibliotecas (Qubit), qualificação das bibliotecas (Bioanalyzer 1000) e a junção das bibliotecas para o sequenciamento. O sequenciamento é um serviço a parte e não está incluído neste processo.

    O material biológico deve obedecer as seguintes condições:

    - A massa de RNA Total necessária para a preparação das bibliotecas é de 3ug;

    - O RNA deve estar íntegro apresentando um valor de integridade > 8 (RIN Bioanalyzer);

    - O fracionamento do RNA no Bioanalyzer faz parte do processo de avaliação de qualidade incluído no serviço.
    Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.

    Sob consulta

  • P01-008D : Construção de bibliotecas de TruSeq RNA Clique para a descrição do serviço oferecido

    O processo de preparação de bibliotecas utilizando o kit TruSeq RNA envolve a quantificação das amostras de RNA (Qubit), qualificação das amostras de RNA (Bioanalyzer 1000), preparação das bibliotecas, quantificação das bibliotecas (Qubit), qualificação das bibliotecas (Bioanalyzer 1000) e a junção das bibliotecas para o sequenciamento. O sequenciamento é um serviço a parte e não está incluído neste processo.

    Este kit permite a que o rRNA seja depletado utilizando um kit de depleção de RNA ribossomal ou enriquecimento para polyA.

    O material biológico deve obedecer as seguintes condições:

    - A massa de RNA Total necessária para a preparação das bibliotecas é de 3 ug;

    - No caso de iniciar a preparação das bibliotecas utilizando mRNA, o mesmo deverá ser obtido a partir de 1 a 4 ug de RNA Total.

    - O RNA deve estar íntegro apresentando um valor de integridade > 8 (RIN Bioanalyzer);

    - O fracionamento do RNA no Bioanalyzer faz parte do processo de avaliação de qualidade incluído no serviço.
    Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.

    Sob consulta

  • P01-008E : Corrida Mid Output v2.5 150 ciclos Clique para a descrição do serviço oferecido

    Corrida NextSeq contendo de 1 a 96 amostras.

    Paired-end 2 x 75 bp.

    As bibliotecas devem ser encaminhadas prontas para serem sequenciadas.

    Será realizada a quantificação (Qubit) do pool de bibliotecas que será sequenciado.
    Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.

    Sob consulta

  • P01-008F : Corrida Mid Output v2.5 300 ciclos Clique para a descrição do serviço oferecido

    Corrida NextSeq contendo de 1 a 96 amostras.

    Paired-end 2 x 150 bp.

    As bibliotecas devem ser encaminhadas prontas para serem sequenciadas.

    Será realizada a quantificação (Qubit) do pool de bibliotecas que será sequenciado.
    Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.

    Sob consulta

  • P01-008G : Corrida High Output v2.5 75 ciclos Clique para a descrição do serviço oferecido

    Corrida NextSeq contendo de 1 a 96 amostras.

    Reads 1 x 75 bp.

    As bibliotecas devem ser encaminhadas prontas para serem sequenciadas.

    Será realizada a quantificação (Qubit) do pool de bibliotecas que será sequenciado.
    Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.

    Sob consulta

  • P01-008H : Corrida High Output v2.5 150 ciclos Clique para a descrição do serviço oferecido

    Corrida NextSeq contendo de 1 a 96 amostras.

    Paired-end 2 x 75 bp.

    As bibliotecas devem ser encaminhadas prontas para serem sequenciadas.

    Será realizada a quantificação (Qubit) do pool de bibliotecas que será sequenciado.
    Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.

    Sob consulta

  • P01-008I : Corrida High Output v2.5 300 ciclos Clique para a descrição do serviço oferecido

    Corrida NextSeq contendo de 1 a 96 amostras.

    Paired-end 2 x 150 bp.

    As bibliotecas devem ser encaminhadas prontas para serem sequenciadas.

    Será realizada a quantificação (Qubit) do pool de bibliotecas que será sequenciado.
    Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.

    Sob consulta

  • P01-008J : Bioanalyzer RNA 6000 Pico Clique para a descrição do serviço oferecido

    O RNA total ou mRNA deverão estar na concentração aproximada de 10ng/ul.

    Cada chip tem a capacidade máxima de 11 amostras.

    Caso o número de amostras seja menor que a capacidade do kit e o usuário não puder esperar outras amostras para completar o chip, será cobrado o valor integral do chip (11 amostras).
    Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.

    Sob consulta

  • P01-008K : Qubit RNA HS, RNA BR, dsDNA HS ou dsDNA BR Requer capacitação prévia Clique para a descrição do serviço oferecido

    O equipamento tem capacidade de leitura de 1 amostra por vez.

    Serão necessários 3,0 ul de amostra para a quantificação.

    A leitura dos padrões será realizada por blocos de amostras a serem quantificadas.
    Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.

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  • P01-008M : Bioanalyzer DNA 1000 Clique para a descrição do serviço oferecido

    A biblioteca de DNA ou RNA deverá estar na concentração aproximada de 30ng/ul.

    Cada chip tem a capacidade máxima de 12 amostras.

    Caso o número de amostras seja menor que a capacidade do kit e o usuário não puder esperar outras amostras para completar o chip, será cobrado o valor integral do chip (12 amostras).
    Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.

    Sob consulta

  • P01-008N : Bioanalyzer High Sensitivity DNA Clique para a descrição do serviço oferecido

    A biblioteca de DNA ou RNA deverá estar na concentração aproximada de 5ng/ul.

    Cada chip tem a capacidade máxima de 11 amostras.

    Caso o número de amostras seja menor que a capacidade do kit e o usuário não puder esperar outras amostras para completar o chip, será cobrado o valor integral do chip (11 amostras).
    Você precisa clicar em “Entrar na Rede” e fazer seu login ou clicar em “cadastrar” para fazer parte da RPT. Desta forma, você poderá verificar as opções de contratação.

    Sob consulta